MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CDC1551 chromosome

Total Repeats: 9899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002755	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002755	A	7	7	1553	1559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002755	TC	4	8	1562	1569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_002755	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002755	AC	4	8	1686	1693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_002755	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_002755	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_002755	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_002755	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_002755	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002755	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002755	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_002755	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_002755	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_002755	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002755	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002755	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002755	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_002755	CGA	3	9	9830	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_002755	GAG	2	6	9859	9864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002755	TCG	2	6	10862	10867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_002755	TCC	2	6	10947	10952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_002755	ACG	2	6	10977	10982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_002755	GGC	2	6	11022	11027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_002755	TCG	2	6	11030	11035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_002755	CCT	2	6	11083	11088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_002755	ACCCG	2	10	11279	11288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_002755	CGG	2	6	11320	11325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_002755	ACG	2	6	11382	11387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_002755	ACC	2	6	11425	11430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_002755	ACC	3	9	11495	11503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_002755	GCC	2	6	11532	11537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_002755	CGA	2	6	11694	11699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_002755	ACT	2	6	11741	11746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_002755	CAT	2	6	11802	11807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_002755	GAC	2	6	11863	11868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_002755	GCC	2	6	12315	12320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_002755	CGG	2	6	12395	12400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_002755	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_002755	CAC	2	6	13577	13582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_002755	CGACC	2	10	13672	13681	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_002755	ATTC	2	8	13691	13698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_002755	CGG	2	6	13702	13707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_002755	GAC	2	6	14032	14037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_002755	C	6	6	23207	23212	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_002755	GC	3	6	23223	23228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_002755	TCG	2	6	23254	23259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_002755	GGT	2	6	23816	23821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002755	TCG	2	6	25458	25463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_002755	TCAA	2	8	25496	25503	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_002755	GAGC	2	8	25524	25531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_002755	GGCC	2	8	25538	25545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002755	CCG	2	6	25559	25564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_002755	CTA	2	6	25594	25599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_002755	TCC	2	6	25611	25616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_002755	GTT	2	6	25618	25623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002755	TCG	3	9	25738	25746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_002755	GCC	2	6	25752	25757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_002755	AAC	2	6	26864	26869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_002755	CGT	2	6	26882	26887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_002755	CTT	2	6	26933	26938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_002755	CGAGC	2	10	26950	26959	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_002755	GCG	2	6	27351	27356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_002755	CGT	2	6	27367	27372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_002755	CCT	2	6	27432	27437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_002755	TA	3	6	27508	27513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002755	GTA	2	6	27547	27552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002755	GTC	2	6	29502	29507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_002755	GCC	3	9	29508	29516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_002755	AC	3	6	29641	29646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_002755	AT	3	6	31055	31060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002755	GCG	2	6	31064	31069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_002755	ACCGCG	2	12	31070	31081	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_002755	ACCA	2	8	31105	31112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_002755	CGG	2	6	31116	31121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_002755	CAA	2	6	31151	31156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_002755	GAG	2	6	31157	31162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002755	AC	3	6	31976	31981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_002755	CAC	2	6	31986	31991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_002755	GAT	2	6	32015	32020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002755	TGG	2	6	33143	33148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002755	G	6	6	33147	33152	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002755	CCGCC	2	10	33752	33761	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
84	NC_002755	GCTA	2	8	33799	33806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_002755	G	6	6	34135	34140	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002755	TCA	2	6	38907	38912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_002755	CG	3	6	38928	38933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_002755	GC	3	6	38938	38943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_002755	CT	3	6	38977	38982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_002755	CG	3	6	38984	38989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_002755	GC	3	6	38994	38999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_002755	CAC	2	6	39774	39779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_002755	TCG	2	6	39796	39801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_002755	GCC	2	6	41170	41175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_002755	GGT	2	6	41231	41236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002755	GAT	2	6	41239	41244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002755	CCG	3	9	41863	41871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_002755	AGC	2	6	41882	41887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_002755	GCGTC	2	10	41888	41897	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_002755	GCC	2	6	42312	42317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_002755	CGT	2	6	43347	43352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_002755	GTG	2	6	43424	43429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002755	CGG	2	6	46423	46428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_002755	CGC	2	6	46478	46483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_002755	CGG	2	6	46490	46495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_002755	CTAC	2	8	47163	47170	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_002755	GCT	2	6	47280	47285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_002755	ATCGG	2	10	47295	47304	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_002755	GTG	2	6	49944	49949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002755	CCT	2	6	51679	51684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_002755	ACG	2	6	51710	51715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_002755	AT	3	6	51747	51752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002755	ACA	2	6	51758	51763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_002755	TAG	2	6	52650	52655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002755	CTGG	2	8	52660	52667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_002755	CCG	2	6	52684	52689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_002755	CAA	2	6	52698	52703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_002755	GGT	2	6	52722	52727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002755	CGT	2	6	52736	52741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_002755	GC	3	6	55647	55652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_002755	AGC	2	6	55661	55666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_002755	CGC	2	6	57970	57975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_002755	TCG	2	6	57979	57984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_002755	GGT	2	6	58007	58012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002755	CCT	2	6	58079	58084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_002755	AGG	2	6	58117	58122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002755	TGA	2	6	58123	58128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002755	GAA	3	9	58480	58488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002755	GCC	2	6	58497	58502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_002755	AGG	2	6	58519	58524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002755	TG	3	6	62973	62978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002755	ATG	2	6	63010	63015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002755	CGG	2	6	63048	63053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_002755	CGT	2	6	63077	63082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_002755	AGG	3	9	63840	63848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002755	TCG	2	6	64923	64928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_002755	CGTCGG	2	12	66680	66691	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_002755	GGT	2	6	66765	66770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002755	TGC	2	6	66803	66808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_002755	TCG	2	6	68529	68534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_002755	AGG	2	6	68553	68558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002755	GC	3	6	71624	71629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_002755	CGG	2	6	71784	71789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_002755	CGT	2	6	72229	72234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_002755	CGT	2	6	72248	72253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_002755	GCG	2	6	74543	74548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_002755	CGA	3	9	74599	74607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_002755	GC	3	6	75209	75214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_002755	GAG	2	6	75269	75274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_002755	CGA	2	6	79041	79046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_002755	GCG	2	6	79106	79111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_002755	CGG	2	6	79185	79190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_002755	GA	3	6	79207	79212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_002755	GAG	2	6	79221	79226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_002755	AC	3	6	79305	79310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_002755	CGGT	2	8	79334	79341	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
161	NC_002755	CGG	2	6	79427	79432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_002755	GGC	2	6	79445	79450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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167	NC_002755	CGG	2	6	80358	80363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_002755	ACC	3	9	80510	80518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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272	NC_002755	GT	3	6	139748	139753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
273	NC_002755	GAG	2	6	139763	139768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
274	NC_002755	TTCT	2	8	139838	139845	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
275	NC_002755	ACGC	2	8	139910	139917	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
276	NC_002755	GAA	2	6	139938	139943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
277	NC_002755	CG	5	10	140186	140195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
278	NC_002755	CGG	2	6	140927	140932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_002755	CTGA	2	8	140941	140948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
280	NC_002755	GATA	2	8	140986	140993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
281	NC_002755	AC	3	6	141042	141047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
282	NC_002755	AGCA	2	8	141082	141089	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
283	NC_002755	CGC	2	6	141105	141110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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443	NC_002755	GCC	2	6	191597	191602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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451	NC_002755	TGC	2	6	191901	191906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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